Pracownia Histopatologiczna zlokalizowana jest na terenie Szpitala Specjalistycznego w Prabutach Sp. z o.o., na I piętrze oddziału nr II. Zakład rozpoczął swoją działalność w 1967 roku, w czasie zarządzania ówczesnym Sanatorium Przeciwgruźliczym przez prof. dr hab. Stanisława Mlekodaja. Przez cały czas swojego istnienia Pracownia współpracuje z Akademią Medyczną w Gdańsku.

Zakład prowadzi działalność na rzecz oddziałów szpitalnych i poradni przyszpitalnych. Świadczy również usługi dla szpitali w Kwidzynie i Sztumie oraz innych Zakładów Opieki Zdrowotnej takich jak: przychodnie, poradnie, prywatne praktyki lekarskie.

Pracownia wykonuje następujące badania:

1. Badania histopatologiczne:
   • śródoperacyjne
   • materiałów pooperacyjnych
   • wycinków endoskopowych
   • biopsji gruboigłowych
   • wyskrobin ginekologicznych
   • wycinków zmian skórnych i innych.
2. Badania cytologiczne:
   • cytologia złuszczeniowa (wydzieliny, plwociny, biopsje szczoteczkowe oskrzela,odciski narządowe, płyny z jam ciała itd.)
   • biopsje aspiracyjne cienkoigłowe( guzów płuc, tarczycy, piersi, wątroby, węzłów chłonnych, ślinianek).
3. Badania histochemiczne
4. Badania immunohistochemiczne

W Pracowni Histopatologicznej pracują:

1. Lekarze patomorfolodzy z II stopniem specjalizacji:
   • dr n. med. Adam Nałęcz
   • lek. med. Monika Markiewicz
   • dr n. med. Robert Rzepko
2. Diagności laboratoryjni:
   • mgr Ewa Kaszubowska
   • mgr Agnieszka Obarowska
3. Technicy:
   • Jadwiga Cendrowska,
   • Joanna Grodzicka,
   • Jolanta Kamińska,
   • Maria Zaremba.
4. Sekretarka medyczna:
   • Anna Włodarczyk

Pracownia Histopatologiczna posiada na wyposażeniu między innymi następujący sprzęt:

1. Automatyczny próżniowy procesor tkankowy Excelsior ES
2. Kriostat Tissuo-Tek Cryo
3. Automatyczne urządzenie do barwień immunohistochemicznych BenchMark GX
4. Cytowirówkę Cyto-Tek
5. Automatyczny Mikrotom Rotacyjny SRM 400
6. Mikrotomy saneczkowe: Mikrotom SM 2000, SM 2010,Microm HM 430
7. System mikroskopii wirtualnej (zawierający skaner z funkcją mikroskopu elektronicznego umożliwiający telekonsultacje) i mikroskopy firmy Olympus
8. Centrum do zatapiania tkanek